外部からの刺激やタスクによって脳の特定部位が賦活される様子を画像化しようとする試み。脳の賦活領域において、血液中の酸素濃度の変化が局所磁場の乱れを生じ、信号強度の大きさの違いに反映されることからＢＯＬＤ（blood oxygenation level dependent）コントラスト法ともよばれる。これは脳の賦活による血液量の増加と脱酸素（デオキシ化）とのアンバランスによって起こると説明されている。脳血流量の増加による血管の信号の増強との明確な区別を行い、賦活領域を特定することが課題となっている。
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