２次元ＭＲ画像はスライス面内の核スピンのＭＲ信号で構成されるが、各核スピンの位置や信号強度の情報は、エコー信号が生じる時点で、スライス面内の一軸（Ｘ軸とする）に沿って磁場勾配Ｇｘを印加しながら信号データを取得することで得られる（信号の読み出し）。Ｇｘを印加すると、これに平行なスピンはその位置に応じたラーモア周波数を有し、撮像視野の一辺がＬであれば撮像視野内の核スピンはγ・Ｇｘ・Ｌの周波数帯域内に存在することになる。これらの周波数成分を含むＭＲ信号をフーリエ変換すれば、ｘ軸方向の位置に応じた信号情報を得られる。これが周波数エンコーディングである。通常は画像の長軸に対応する。
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